Законы, регулирующие работу бизнеса, постоянно меняются, что уже само по себе создает трудности. Так, утвержденные Минфином РФ "Основные направления налоговой политики РФ на 2012 год и на плановый период 2013 и 2014 годов" предполагают сокращение сферы применения ЕНВД с 01.01.13 и отмену данной системы налогообложения с 01.01.14. Одним из шагов по упразднению ЕНВД является введение в НК РФ главы "Патентная система налогообложения". В результате организации и ИП должны выбрать: ОСНО, УСН или патент для ИП. В переходный период малому бизнесу может быть предоставлена возможность выбора между патентной системой налогообложения и ЕНВД. Об этом сообщил директор департамента налоговой и таможенно-тарифной политики Минфина РФ И. Трунин. "Наша позиция - с появлением патентной системы ЕНВД надо отменять, но какое-то время они могут существовать вдвоем, и Минэкономразвития против этого не возражает. Вопрос в том, нужно ли предоставлять возможность выбора тем, кто хочет применять ЕНВД или патентную систему. В принципе я думаю, что можно разрешить возможность выбора", – цитирует слова чиновника пресс-служба Минфина. Предполагается, что Минфин и Минэкономразвития выскажут свою единую позицию по данному вопросу в рамках второго чтения законопроекта, предусматривающего отмену "вмененки" и введение патентной системы.

Не вносит спокойствия и заявление заместителя директора департамента налоговой и таможенно-тарифной политики Минфина РФ С. Разгулина, о том, что планируется следующая концепция налогообложения:

к "микробизнесу" должна применяться патентная система налогообложения, к малому бизнесу - УСН, а к остальным - ОСНО.

Также принят новый Федеральный закон от 06.12.11 № 402-ФЗ "О бухгалтерском учете", согласно которому с 01.01.13 вести бухгалтерский учет должны будут все экономические субъекты (в том числе перешедшие на УСН). Кроме того, существенно повышается и ответственность руководителей.